Entwicklung einer Webplattform zur Analyse und Visualisierung von molekularbiologischen Daten im Kontext der Multiple Sklerose Forschung

Abstract

Gegenstand der Arbeit ist die Entwicklung einer Webplattform zur Analyse von Proteinsequenzen im Kontext der Multiple Sklerose Forschung. Hierfür werden zwei Programme der Bioinformatik, SYFPEITHI und das »MHC-II binding prediction«-Programm gekoppelt. Die Funktionalität der beiden Programme wird durch die Integration in eine eigene Software erweitert. Die Analyseergebnisse werden dem Benutzer auf unterschiedliche Arten visualisiert und in einer Datenbank abgespeichert. Entwickelt wird die Software in der Programmiersprache Python mit dem Django-Webframework unter Verwendung der Web-Technologie jQuery.

Topic of this paper is the development of a web application which combines two tools for the binding prediction of peptides on MHC-II molecules. The new developed software enhances and visualises the output of the two bioinformatics applications. The new gathered scientific data is stored in a relational database and is used for further analysis. The software is developed as a rich internet application and makes use of the Django webframework and advanced web technologies like the jQuery JavaScript library.